Istnieje możliwość składania korekt JPK. Konieczne jest przesłanie poprawionego JPK w całości. W przypadku wysłania pliku JPK_VAT z błędną nazwą kontrahenta, nie jest konieczne ponowne przesłanie skorygowanego pliku.
Korekty za rok 2016
Do końca roku 2016 obowiązywała struktura JPK_VAT(1), czyli wariant pierwszy. Odpowiadała ona deklaracji VAT-7(16). Od dnia 1 stycznia 2017 roku, obowiązuje struktura JPK_VAT(2), czyli wariant drugi, odpowiadający deklaracji VAT-7(17).
Mimo iż podatnik składając korektę deklaracji VAT-7 za rok 2016 używa formularza VAT-7(16), nie ma obecnie możliwości przesłania JPK w strukturze JPK_VAT(1). Wynika z tego, że podatnik musi złożyć korektę JPK przy pomocy struktury JPK_VAT(2).